Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk5rap2Q8K389 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms