Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm1Q8K377 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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