Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sash3Q8K352 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sash3Q8K352 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms