Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ncapd2Q8K2Z4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms