Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q5

Chchd7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd7Q8K2Q5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Chchd7Q8K2Q5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Chchd7Q8K2Q5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Chchd7Q8K2Q5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Chchd7Q8K2Q5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms