Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc12Q8K2L8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc12Q8K2L8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms