Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c1Q8K284 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c1Q8K284 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms