Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Polr1eQ8K202 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms