Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkd3Q8K1Y2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prkd3Q8K1Y2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms