Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sde2Q8K1J5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sde2Q8K1J5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms