Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sh2d5Q8JZW5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms