Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf628Q8CJ78 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms