Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LgsnQ8CIX8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LgsnQ8CIX8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms