Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CopaQ8CIE6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms