Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI51

Pdlim5, PDZ and LIM domain protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim5Q8CI51 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim5Q8CI51 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms