Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cog3Q8CI04 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms