Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upp2Q8CGR7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upp2Q8CGR7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms