Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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