Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ufl1Q8CCJ3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms