Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Fbxo48Q8CAT8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Fbxo48Q8CAT8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Fbxo48Q8CAT8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Fbxo48Q8CAT8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Fbxo48Q8CAT8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Fbxo48Q8CAT8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fbxo48Q8CAT8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms