Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nhsl1Q8CAF4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nhsl1Q8CAF4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nhsl1Q8CAF4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nhsl1Q8CAF4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nhsl1Q8CAF4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nhsl1Q8CAF4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nhsl1Q8CAF4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nhsl1Q8CAF4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nhsl1Q8CAF4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nhsl1Q8CAF4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nhsl1Q8CAF4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nhsl1Q8CAF4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nhsl1Q8CAF4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nhsl1Q8CAF4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nhsl1Q8CAF4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nhsl1Q8CAF4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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