Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A430089I19RikQ8C9W1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
A430089I19RikQ8C9W1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A430089I19RikQ8C9W1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A430089I19RikQ8C9W1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A430089I19RikQ8C9W1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A430089I19RikQ8C9W1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A430089I19RikQ8C9W1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A430089I19RikQ8C9W1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A430089I19RikQ8C9W1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A430089I19RikQ8C9W1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A430089I19RikQ8C9W1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A430089I19RikQ8C9W1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A430089I19RikQ8C9W1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A430089I19RikQ8C9W1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A430089I19RikQ8C9W1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A430089I19RikQ8C9W1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A430089I19RikQ8C9W1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A430089I19RikQ8C9W1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A430089I19RikQ8C9W1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A430089I19RikQ8C9W1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A430089I19RikQ8C9W1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A430089I19RikQ8C9W1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A430089I19RikQ8C9W1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms