Protein–RNA interactions for Protein: Q8C966

Phf21b, PHD finger protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf21bQ8C966 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf21bQ8C966 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf21bQ8C966 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms