Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc113Q8C5T8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc113Q8C5T8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms