Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4D8

Gm11541, Predicted gene 11541, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11541Q8C4D8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm11541Q8C4D8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm11541Q8C4D8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm11541Q8C4D8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm11541Q8C4D8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm11541Q8C4D8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm11541Q8C4D8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm11541Q8C4D8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm11541Q8C4D8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm11541Q8C4D8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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