Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atg16l1Q8C0J2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms