Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FarsaQ8C0C7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FarsaQ8C0C7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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FarsaQ8C0C7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FarsaQ8C0C7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FarsaQ8C0C7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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FarsaQ8C0C7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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FarsaQ8C0C7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FarsaQ8C0C7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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FarsaQ8C0C7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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FarsaQ8C0C7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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FarsaQ8C0C7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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