Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccser1Q8C0C4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccser1Q8C0C4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms