Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfsfm13Q8BXS2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tnfsfm13Q8BXS2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms