Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrtm1Q8BXQ3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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