Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA0

Lrfn5, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn5Q8BXA0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn5Q8BXA0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn5Q8BXA0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms