Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTE0

Sdhaf4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf4Q8BTE0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdhaf4Q8BTE0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdhaf4Q8BTE0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms