Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms