Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem260Q8BMD6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms