Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zcchc4Q8BKW4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms