Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpc2Q8BKV1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc2Q8BKV1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms