Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan9Q8BJU2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms