Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ9

Csgalnact1, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact1Q8BJQ9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csgalnact1Q8BJQ9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csgalnact1Q8BJQ9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms