Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nup93Q8BJ71 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nup93Q8BJ71 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms