Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW4

4933430I17Rik, RIKEN cDNA 4933430I17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933430I17RikQ8BHW4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4933430I17RikQ8BHW4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms