Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH24

Tm9sf4, Transmembrane 9 superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf4Q8BH24 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm9sf4Q8BH24 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms