Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp4f39Q8BGU0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms