Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vipas39Q8BGQ1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Vipas39Q8BGQ1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Vipas39Q8BGQ1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Vipas39Q8BGQ1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vipas39Q8BGQ1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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