Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trmt12Q8BG71 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms