Protein–RNA interactions for Protein: Q811Q9

Pcyt1b, Choline-phosphate cytidylyltransferase B, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcyt1bQ811Q9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pcyt1bQ811Q9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pcyt1bQ811Q9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms