Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms