Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NfascQ810U3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfascQ810U3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms