Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ChfrQ810L3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ChfrQ810L3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms