Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cracr2bQ80ZJ8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cracr2bQ80ZJ8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cracr2bQ80ZJ8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cracr2bQ80ZJ8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cracr2bQ80ZJ8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cracr2bQ80ZJ8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms