Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Amigo1Q80ZD8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Amigo1Q80ZD8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Amigo1Q80ZD8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms